深圳市爱心智慧儿童康复中心创办于2009年3月,是由一位自闭症孩子的家长怀着一颗对自闭症孩子的关爱之心而办的。当时在深圳宝安对于自闭症康复服务点严重缺乏，这位家长不畏艰辛创办了这家机构，为宝安区的自闭症孩子提供了便利。早期是以加盟“爱慧”的形式，于2010年6月在深圳市民政局登记注册成为非营利性民间社团。